Der Masterstudiengang Bioinformatik hat das Ziel den Studenten für Forschung und Anwendung im Bereich der Bioinformatik zu qualifizieren. Dies setzt zunächst eine solide Ausbildung in den formalen Techniken der Informatik voraus. Zusätzlich zu den durch ein Informatikstudium vermittelten Tätigkeiten wird vom Bioinformatiker eine Vertrautheit mit den Problemen der Biologie erwartet, wie sie nur durch eine vertiefte Beschäftigung mit dieser Disziplin zu erlangen ist.
Neben Vermittlung und Ausbau informatischer und biologischer Kenntnisse hat der Studiengang die Aufgabe diese Disziplinen zu integrieren. Dies wird in der tragenden Säule des Master- Programms, dem Bereich der Bioinformatik vermittelt.
Das Pflichtprogramm des Master-Studiengangs stellt eine breite Abdeckung aller für den Bioinformatiker bedeutsamen Teilgebiete sicher. Zahlreiche Wahlmöglichkeiten gestatten dennoch eine individuelle Spezialisierung.

Voraussetzungen: Als konsekutiv konzipierter Studiengang setzt der Master Bioinformatik zusätzlich zu fundierten Informatik-Grundkenntnissen ein Basiswissen in Biologie und in Bioinformatik voraus. Dieses Wissen wird typischerweise im einem Bachelor Informatik mit dem Nebenfach Bioinformatik vermittelt, wie er an der Universität Freiburg angeboten wird.

Der Master-Studiengang umfasst Module aus den Bereichen

• Bioinformatik
• Weiterführende Informatik
• Spezialisierung Informatik/Biologie
• Biologie
• Mathematik

Im Bereich Bioinformatik bilden die Module

• Bioinformatik II
• Allgemeine Grundlagen der Bioinformatik
• Genom-Bioinformatik

das Fundament der bioinformatik-spezifischen Ausbildung. Zur Vertiefung sind mindestens 2 Spezialvorlesungen zu belegen.

Derzeit werden folgende Spezialvorlesungen angeboten:

• RNA Bioinformatik
• Vereinfachte Proteinmodelle
• Bioinformatik und Molekularbiologie von RNA
• Angewandte Systembiologie
  
• Theoretische Systembiologie
  

Der Bereich Weiterführende Informatik soll das Informatik-Grundwissen in einem der folgenden Module ausbauen

• Künstliche Intelligenz
• Rechnerarchitektur
• Algorithmentheorie
• Bildverarbeitung

Zusätzlich ist verpflichtend die Vorlesung Machine Learning aus dem Gebiet der Künstlichen Intelligenz zu belegen. Techniken des Machine Learning sind in vielen Zweigen der Bioinformatik von besonderer Bedeutung.

Der Bereich Spezialisierung Informatik/Biologie dient dem Ausbau und der Vertiefung des Wissens in der Informatik und/oder Biologie. Es sind dafür zwei Vorlesungen aus
dem Angebot an Spezialvorlesungen der Informatik und/oder Biologie zu wählen - davon mindestens eine Informatikvorlesung, um eine ausreichende Vertiefung in der Informatik sicherzustellen.

Ein wichtiges Ziel des Masters besteht in der Vermittlung biologischer Basiskenntnisse, die dem zukünftigen Bioinformatiker den Hintergrund seiner Tätigkeit und die Grundlage der Auseinandersetzung mit fortgeschrittenen biologischen Konzepten bieten. Im Bereich Biologie sind deshalb Veranstaltungen im Umfang von 18 ECTS (in der Regel 6 Vorlesungen) aus dem Angebot der Biologie und Biochemie vorgesehen.
Dabei soll gehört werden

•  Molekularbiologie und Genetik: Gene und Genom
• Entwicklungsbiologie/Genetik

das sonstige Angebot umfasst unter anderem die Themen

• Biochemie
• Mikrobiologie
• Zellbiologie
• Neurobiologie und Biophysik
  
• Fortgeschrittene Genetik und Molekularbiologie
  
• Fortgeschrittene Themen der Entwicklungsbiologie

Aus der Mathematik wird das für die Bioinformatik besonders bedeutsame Gebiet der Statistik durch eine entsprechende Vorlesung abgedeckt.

Zusätzlich beinhaltet das Master-Curriculum:

• Praktikum in Bioinformatik oder Biologie. Die Studierenden haben hier die Möglichkeit praktische Erfahrungen zu sammeln, indem sie größere Projekte eines Spezialgebiets bearbeiten.
  

• Seminare. Es sind zwei Bioinformatik-Seminare verpflichtend, in denen die Studierenden Referate zu bestimmten Themen ausarbeiten, halten und diskutieren.

• Ein Team-Projekt oder Großpraktikum. Im dritten Semester werden die Studierenden in die laufende Forschungsarbeit des Instituts und/oder der biologischen Fakultät einbezogen. Sie wählen eine Abteilung und einen Professor als ihren Mentor aus und arbeiten einzeln oder in einem kleinen Team von Master-Studenten an einem konkreten Projekt. Auf diese Weise werden die Studierenden mit konkreten Forschungsfragen konfrontiert. Neben technischen Fähigkeiten lernen die Studierenden dabei, ihre Arbeit zu strukturieren und in einem Team zusammen zu arbeiten und zu kommunizieren.
  

• Eine Masterarbeit: Während des vierten und letzten Semesters arbeiten die Studierenden an ihrer Masterarbeit. Ziel der Masterarbeit ist, eine Fragestellung aus der Forschung in Zusammenarbeit mit einem Professor und seinen Mitarbeitern wissenschaftlich zu bearbeiten.

Evaluation und Kreditpunktesystem

• Individueller Studienplan: Die Studierenden können ihren Studienplan im Rahmen der durch die Prüfungsordnung festgesetzten Vorgaben aufgrund ihrer persönlichen Vorstellungen frei zusammenstellen. Es kann jedoch sein, dass abhängig von der fachlichen Ausrichtung des vom jeweiligen Studierenden absolvierten Bachelor-Studiums, nicht alle Spezialisierungsbereiche wählbar sind.

• Prüfungen: Jedes Modul wird mit einer Prüfung abgeschlossen. Es gibt mündliche und schriftliche Prüfungen.

• Kreditpunkte: Für jede erfolgreich absolvierte Prüfung erhält der Studierende Kreditpunkte gemäß des European Credit Transfer System (ECTS).

Unterrichtssprache

Der Master-Studiengang ist zweisprachig. Die Lehrveranstaltungen werden in Englisch und/oder Deutsch angeboten. Deshalb werden von den Studierenden sowohl Englischkenntnisse als auch Grundkenntnisse der deutschen Sprache erwartet. Von Nicht-Muttersprachlern wird ein Nachweis der jeweiligen Sprachfähigkeiten durch einschlägige Sprachtests erwartet (TOEFL für Englisch bzw. DSH-2 oder PNDS, TestDAF für die deutsche Sprache). Studieninteressenten, die ihre Sprachkenntnisse während oder vor Antritt des Studiums verbessern möchten, bietet die Universität ein reichhaltiges Angebot an Sprachkursen (vgl. www.sli.uni-freiburg.de).